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Browsing by Author "Miller, C."

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    Dynamic transcriptome analysis measures rates of mRNA synthesis and decay in yeast
    (2011)
    Miller, C.
    ;
    Schwalb, B.
    ;
    Maier, K.  
    ;
    Schulz, D.
    ;
    Duemcke, S.
    ;
    Zacher, B.
    ;
    Mayer, A.
    ;
    Sydow, J.
    ;
    Marcinowski, L.
    ;
    Doelken, L.
    ;
    Martin, D. E.
    ;
    Tresch, A.
    ;
    Cramer, P.  
    To obtain rates of mRNA synthesis and decay in yeast, we established dynamic transcriptome analysis (DTA). DTA combines non‐perturbing metabolic RNA labeling with dynamic kinetic modeling. DTA reveals that most mRNA synthesis rates are around several transcripts per cell and cell cycle, and most mRNA half‐lives range around a median of 11 min. DTA can monitor the cellular response to osmotic stress with higher sensitivity and temporal resolution than standard transcriptomics. In contrast to monotonically increasing total mRNA levels, DTA reveals three phases of the stress response. During the initial shock phase, mRNA synthesis and decay rates decrease globally, resulting in mRNA storage. During the subsequent induction phase, both rates increase for a subset of genes, resulting in production and rapid removal of stress‐responsive mRNAs. During the recovery phase, decay rates are largely restored, whereas synthesis rates remain altered, apparently enabling growth at high salt concentration. Stress‐induced changes in mRNA synthesis rates are predicted from gene occupancy with RNA polymerase II. DTA‐derived mRNA synthesis rates identified 16 stress‐specific pairs/triples of cooperative transcription factors, of which seven were known. Thus, DTA realistically monitors the dynamics in mRNA metabolism that underlie gene regulatory systems.
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    International consensus on the most useful physical examination tests used by physiotherapists for patients with headache: A Delphi study
    (Churchill Livingstone, 2016)
    Luedtke, Kerstin
    ;
    Boissonnault, W.
    ;
    Caspersen, N.
    ;
    Castien, R.
    ;
    Chaibi, A.
    ;
    Falla, Deborah  
    ;
    Fernandez-de-las-Penas, Cesar
    ;
    Hall, T.
    ;
    Hirsvang, J. R.
    ;
    Horre, T.
    ;
    Hurley, D.
    ;
    Jull, Gwendolen
    ;
    Kroll, L. S.
    ;
    Madsen, B. K.
    ;
    Mallwitz, J.
    ;
    Miller, C.
    ;
    Schaefer, B.
    ;
    Schoettker-Koeniger, T.
    ;
    Starke, W.  
    ;
    von Piekartz, H.
    ;
    Watson, D.
    ;
    Westerhuis, P.
    ;
    May, A.
    Background: A wide range of physical tests have been published for use in the assessment of musculoskeletal dysfunction in patients with headache. Which tests are used depends on a physiotherapist's clinical and scientific background as there is little guidance on the most clinically useful tests. Objectives: To identify which physical examination tests international experts in physiotherapy consider the most clinically useful for the assessment of patients with headache. Design/methods: Delphi survey with pre-specified procedures based on a systematic search of the literature for physical examination tests proposed for the assessment of musculoskeletal dysfunction in patients with headache. Results: Seventeen experts completed all three rounds of the survey. Fifteen tests were included in round one with eleven additional tests suggested by the experts. Finally eleven physical examination tests were considered clinically useful: manual joint palpation, the cranio-cervical flexion test, the cervical flexion-rotation test, active range of cervical movement, head forward position, trigger point palpation, muscle tests of the shoulder girdle, passive physiological intervertebral movements, reproduction and resolution of headache symptoms, screening of the thoracic spine, and combined movement tests. Conclusions: Eleven tests are suggested as a minimum standard for the physical examination of musculoskeletal dysfunctions in patients with headache. (C) 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.
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    Kollaborationen bei kinderanästhesiologischen Publikationen im D-A-CH-Raum
    (2024)
    Dejaco, Alexander
    ;
    Nemeth, M.
    ;
    Sablewski, A.
    ;
    Rosenberger, J.
    ;
    Miller, C.
    Zusammenfassung Hintergrund Kollaborationen sind ein wesentlicher Baustein wissenschaftlichen Arbeitens und speziell für Bereiche wie die Kinderanästhesiologie besonders bedeutsam, wo ein geringes Evidenzlevel besteht. Eine kürzlich durchgeführte szientometrische Analyse ergab eine geografische Diversifizierung der Publikationsaktivität in der Kinderanästhesie innerhalb der letzten 2 Jahrzehnte, begleitet von einem Anstieg internationaler Kooperationen. Ziele Vor dem Hintergrund der Hypothese eines ähnlichen Wachstums der Aktivität und Dynamik von Veröffentlichungen in der Kinderanästhesie bestand das Ziel dieser szientometrischen Studie darin, die Publikationsaktivität und Kooperationsgewohnheiten in der Kinderanästhesieforschung in Deutschland, Österreich und der Schweiz (D-A-CH) zu analysieren. Methode Diese Sekundäranalyse schloss alle kinderanästhesiologischen Publikationen mit Zugehörigkeit aus dem D‑A-CH-Raum zwischen 2001 und 2020 aus PubMed und Web of Science ein. Publikationen wurden anhand der Korrespondenzadresse zugeordnet. Primärer Endpunkt war die Publikationsaktivität und -dynamik, dargestellt anhand der Anzahl der Veröffentlichungen und den jeweiligen Wachstumsraten. Sekundäre Endpunkte waren die Anteile an Kollaborationen auf staatlicher und institutioneller Ebene. Ergebnisse Insgesamt wurden 3406 kinderanästhesiologische Publikationen mit Beteiligung aus dem D‑A-CH-Raum identifiziert, davon 2807 (82,4 %) mit Korrespondenzadresse. Die durchschnittliche jährliche Wachstumsrate an Publikationen mit Korrespondenzadresse lag für den D‑A-CH-Raum bei + 2,9 % und bei Kollaborationen + 7,7 %. Kollaborationen fanden überwiegend zwischen Institutionen innerhalb des D‑A-CH-Raums statt, aber Schweizer Institutionen hatten einen höheren Anteil an internationalen Kollaborationen. Diskussion Die Aktivität bei kinderanästhesiologischen Publikationen aus dem D‑A-CH-Raum nahm in den letzten beiden Dekaden stetig zu, wobei Kollaborationen eine überproportionale Zunahme verzeichneten. Es bleibt zu wünschen, dass sich mit der wachsenden Bedeutung von Kollaborationen auch die Evidenzlage in der Kinderanästhesie weiter verbessert.
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    Mediator Phosphorylation Prevents Stress Response Transcription During Non-stress Conditions
    (2012)
    Miller, C.
    ;
    Matic, I.
    ;
    Maier, K. C.
    ;
    Schwalb, B.
    ;
    Roether, S.
    ;
    Straesser, K.
    ;
    Tresch, A.
    ;
    Mann, M.
    ;
    Cramer, P.  
    The multiprotein complex Mediator is a coactivator of RNA polymerase (Pol) II transcription that is required for the regulated expression of protein-coding genes. Mediator serves as an end point of signaling pathways and regulates Pol II transcription, but the mechanisms it uses are not well understood. Here, we used mass spectrometry and dynamic transcriptome analysis to investigate a functional role of Mediator phosphorylation in gene expression. Affinity purification and mass spectrometry revealed that Mediator from the yeast Saccharomyces cerevisiae is phosphorylated at multiple sites of 17 of its 25 subunits. Mediator phosphorylation levels change upon an external stimulus set by exposure of cells to high salt concentrations. Phosphorylated sites in the Mediator tail subunit Med15 are required for suppression of stress-induced changes in gene expression under non-stress conditions. Thus dynamic and differential Mediator phosphorylation contributes to gene regulation in eukaryotic cells.
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    Perioperatives Wärmemanagement bei Kindern
    (2024)
    Braeuer, A.
    ;
    Nemeth, M.
    ;
    Fazliu, A.
    ;
    Eberhardt, I. M.
    ;
    Stein, D.
    ;
    Miller, C.
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    Praxis des perioperativen Wärmemanagements in der Kinderanästhesie – eine Fragebogenerhebung auf der Jahrestagung des wissenschaftlichen Arbeitskreises Kinderanästhesie 2022
    (2023)
    Bräuer, A.
    ;
    Miller, C.
    ;
    Becke-Jakob, K.
    ;
    Nemeth, M.
    Fragestellung: Die Aufrechterhaltung von perioperativer Normothermie gehört zu den 10-N-Qualitätskriterien einer sicheren Kinderanästhesie. Während bei Erwachsenen zahlreiche evidenzbasierte Empfehlungen existieren, ist die Evidenzlage bei Kindern gering. Ziel dieser Arbeit ist, verschiedene Vorgehensweisen und unterschiedliche Strategien zu eruieren. Methodik: Die Teilnehmer*innen der Jahrestagung des wissenschaftlichen Ar­beitskreises Kinderanästhesie der DGAI (16. – 18. Juni 2022 in Kronberg) erhielten einen Fragebogen zu ihrer täglichen Praxis des perioperativen Wärmemanagements bei Kindern. Die 14 Fragen adressierten Herangehensweisen bezüglich Standards, OP-Saaltemperatur, angewendeter Wärmestrategie, Messverfahren sowie Einschätzung der Effektivität. Die Teilnahme war freiwillig und anonym. Ergebnisse: 65 von 94 Fragebogen wurden ausgewertet. Bei 56 % bestehen schriftliche Standards zum perioperativen Wärmemanagement, bei 28 % davon spezifische Standards für Kinder. Die mediane OP-Saaltemperatur für Kinder unter 1 Jahr beträgt 26,0 (erstes bis drittes Quartil: 24,0 bis 26,0) °C, für Kinder über 1 Jahr 24,0 (22,0 bis 24,8) °C. 46 % führen keine aktive Vor­- wärmung durch. Die initialen Temperatureinstellungen konvektiver Wärmesysteme betragen 40,0 (38,8 bis 43,0) °C, 89 % verstellen diese im Verlauf nach persönlichen Einschätzungen. Die Körperkerntemperatur (KKT) wird am häufigsten oro- und nasopharyngeal sowie rektal gemessen. Die Prävalenz von perioperativer Hypothermie (KKT < 36 °C) wurde auf 5 (2 bis 10) % geschätzt, jene der Hyperthermie (KKT > 38 °C) auf 10 (5 bis 10) %. 51 % der Befragten beschreiben in ihrer täglichen Praxis eine höhere Rate an Hyperthermien als an Hypothermien. Schlussfolgerungen: Das perioperative Wärmemanagement bei Kindern ist he­terogen. Sinnvolle und evidenzbasierte Strategien scheinen dringend erforderlich, um sowohl Hypo- als auch Hyperthermien zu vermeiden.
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    The loess-paleosol profile Datthausen, on the penultimate-glacial terrace of the upper Danube River: Sedimentological and paleopedological characteristics
    (2015)
    Sauer, Daniela  
    ;
    Kadereit, Annette
    ;
    Kühn, Peter  
    ;
    Herrmann, L.
    ;
    Kösel, Michael
    ;
    Miller, C.
    ;
    Shinonaga, T.
    ;
    Kreutzer, S.
    ;
    Starkovich, B.

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